Оплата праці Голови Державного агентства лісових ресурсів України, першого заступника та заступника здійснюється, зокрема, відповідно до Кодексу законів про працю України, Законів України «Про оплату праці», «Про державну службу», постанов Кабінету Міністрів України «Про види, розміри і порядок надання компенсації громадянам у зв’язку з роботою, яка передбачає доступ до державної таємниці» від 15 червня 1994 року № 414, «Про затвердження Порядку обчислення середньої заробітної плати» від 8 лютого 1995 року № 100, «Питання оплати праці працівників державних органів» від 18 січня 2017 року № 15.

Заробітна плата Голови Держлісагентства та його заступників складається з посадового окладу, надбавки за ранг, надбавки за вислугу років, надбавки за роботу з документами, що становлять державну таємницю .

Премія, надбавка за інтенсивність праці та надбавка за виконання особливо важливої роботи Голові Держлісагентства та його заступникам може встановлюватись за погодженням з Міністром захисту довкілля та природних ресурсів України, який спрямовує та координує діяльність центрального органу виконавчої влади.